バイオインフォマティクス解析 | bit-MAP®受託サービス

バイオインフォマティクス解析の特徴

当社では、微生物ゲノムに特化したバイオインフォマティクス解析技術を保有しています。
シングルセルゲノム、ショットガンメタゲノムに加えて、それらを統合した解析サービスを提供しております。

ccSAG解析: 弊社独自のシングルセルゲノムデータに特化した解析手法で、SAGキメラ除去・同一株SAG統合により、ゲノム情報を高品質化します。さらに、得られたゲノム情報 (ccSAG) について､生物種推定及び遺伝子予測を行います。

MAG解析: 生リードのアッセンブル後、配列断片のビニング (ゲノムの再構築) を行い、MAG (Metagenome Assembled Genome) を構築します。さらに、MAGの生物種推定及び遺伝子予測を行います。

弊社が独自に解析したシングルセルゲノム解析結果とショットガンメタゲノム解析結果の統合解析手法を用いて、微生物ゲノム情報を高品質化します。さらに、得られたゲノム情報について、生物種推定及び遺伝子予測を行います。

ご要望に合わせて幅広い解析オプションを準備しております。
複数サンプルの場合は割引もございますので、お問い合わせ下さい。

解析メニュー	概要	納品物	発注可能単位	単価 (税抜)
オプション基本料金	オプション解析を1項目以上実施する際に発生する基本料金	–	1発注	100,000円
SAG-MAG 統合解析	シングルセルゲノムとメタゲノムを統合し、より高品質なドラフトゲノムを構築・統合解析・ドラフトゲノム品質評価・生物種推定・遺伝子推定	・解析レポート・ドラフトゲノム配列・遺伝子塩基配列・遺伝子アミノ酸配列・遺伝子一覧表	1サンプル	100,000円

解析メニュー	概要	納品物	発注可能単位	単価 (税抜)
ccSAG解析	同一株のSAGを統合し、冗長性のないドラフトゲノムを作成・同一株の同定・キメラリード除去・アセンブル・ドラフトゲノム品質評価・生物種推定・遺伝子推定	・解析レポート・ドラフトゲノム配列・遺伝子塩基配列・遺伝子アミノ酸配列・遺伝子一覧表	1サンプル	100,000円
系統樹解析	・複数のゲノム配列の系統関係の推定	・系統樹図	1サンプル	100,000円
生合成遺伝子クラスター解析	・生合成遺伝子クラスターのアノテーション	・アノテーション結果一覧表	1サンプル	100,000円
抗生物質耐性遺伝子解析	・抗生物質耐性遺伝子のアノテーション	・アノテーション結果一覧表	1サンプル	100,000円

解析メニュー	概要	納品物	発注可能単位	単価 (税抜)
メタゲノム解析（菌叢プロファイリング等）	メタゲノムの全容解析・アセンブル・遺伝子推定・細菌叢プロファイル推定	・アセンブル塩基配列・遺伝子塩基配列・遺伝子アミノ酸配列・遺伝子一覧表・細菌叢プロファイル	8サンプル	100,000円
MAG解析	メタゲノムアセンブル塩基配列を分別して、ドラフトゲノム配列を構築・アセンブル・配列断片のビニング・ドラフトゲノム品質評価・微生物系統解析・遺伝子推定	・ドラフトゲノム配列・遺伝子塩基配列・遺伝子アミノ酸配列・遺伝子一覧表	8サンプル	100,000円
生合成遺伝子クラスター解析	・生合成遺伝子クラスターのアノテーション	・アノテーション結果一覧表	8サンプル	100,000円
抗生物質耐性遺伝子解析	・抗生物質耐性遺伝子のアノテーション	・アノテーション結果一覧表	8サンプル	100,000円