Uncultured prokaryotic genomes in the spotlight: An examination of publicly available data from metagenomics and single-cell genomics
Arikawa K. et al Computational and Structural Biotechnology Journal(2023) DOI:https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.09.010
Tools for microbial single-cell genomics for obtaining uncultured microbial genomes
Hosokawa M et. al Biophys Rev.(2023) DOI:https://doi.org/10.1007/s12551-023-01124-y
Target enrichment of uncultured human oral bacteria with phage-derived molecules found by single-cell genomics
Hosokawa M et. al Journal of Bioscience and Bioengineering.(2023) DOI：https://doi.org/10.1016/j.jbiosc.2023.04.005
Revealing within-species diversity in uncultured human gut bacteria with single-cell long-read sequencing
Kogawa M et. al Front. Microbiol.(2023) DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1133917
Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral
Ide K et. al Microbiome. (2022) DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-022-01395-9
Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing
Ide K et. al Front. Microbiol.(2022), DOI https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.955404
Massively parallel single-cell genomics of microbiomes in rice paddies
Aoki, W. et al Front. Microbiol. (2022), DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.1024640
Strain-level profiling of viable microbial community by selective single-cell genome sequencing
Hosokawa M, Endo T et al. Scientific Report(2022) DOI https://doi.org/10.1038/s41598-022-08401-y
Recovery of strain-resolved genomes from human microbiome through an integration framework of single-cell genomics and metagenomics
Arikawa K. et al Microbiome (2021) DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-021-01152-4
High-Quality Draft Single-Cell Genome Sequences of Two Gammaproteobacteria Strains Sampled from Soil in a Strawberry Farm.
Yoda T et al. Genome Resource Announcement. (2020) DOI: 10.1128/MRA.00743-20
日本微生物生態学会 第36回浜松大会
| 日程: | 2023年11月28日 |
|---|---|
| 演題名: | 土壌試料からの未培養微生物ゲノムの大規模収集 |
| 形式: | 口頭発表 |
第61回 日本生物物理学会年会
| 日程: | 2023年11月15日 |
|---|---|
| 演題名: | 次世代バイオものづくりのための未培養微生物ゲノムデータベース |
| 形式: | 口頭発表 |
酵素工学研究会第90回講演会
| 日程: | 2023年11月10日 |
|---|---|
| 演題名: | 微生物シングルセルゲノム解析技術を用いた大規模遺伝子データベースからの有用酵素探索 |
| 形式: | 口頭発表 |
情報計算化学生物(CBI)学会 2023年大会
| 日程: | 2023年10月24-26日 |
|---|---|
| 演題名: | Efficient enzyme discovery from microbial gene databases and molecular surface features of 3D structures |
| 形式: | ポスター |
Enzyme Engineering XXVII
| 日程: | 2023年10月1-6日 |
|---|---|
| 演題名: | Harnessing environmental microbiota for the discovery of novel biocatalytic enzymes using microbial single-cell genome sequencing |
| 形式: | ポスター |
3rd Japan-Switzerland-Germany Workshop on Biocatalysis and Bioprocess Development
| 日程: | 2023年9月12日 |
|---|---|
| 演題名: | Efficient enzyme discovery from complex environmental microbiota using microbial single-cell genome sequencing |
| 形式: | 口頭発表 |
| 日程: | 2023年9月12日 |
|---|---|
| 演題名: | Novel PET hydrolases from a microbial single-cell genome database |
| 形式: | 口頭発表 |
2023年日本バイオインフォマティクス学会年会
| 日程: | 2023年9月8日 |
|---|---|
| 演題名: | 多様な環境におけるメタゲノムとシングルセルゲノムの比較／統合技術 |
| 形式: | 口頭発表 |
| 日程: | 2023年9月7-9日 |
|---|---|
| 演題名: | A study of total 30K single amplified genomes from the human oral/gut microbiota |
| 形式: | ポスター |
第75回日本生物工学会大会
| 日程: | 2023年9月4日 |
|---|---|
| 演題名: | 未培養微生物ゲノムデータベースからの有用酵素探索 |
| 形式: | 口頭発表 |
| 日程: | 2023年9月4日 |
|---|---|
| 演題名: | 未培養微生物の遺伝子獲得に向けたシングルセルゲノミクスの活用 |
| 形式: | 口頭発表 |
第27回 腸内細菌学会学術集会
| 日程: | 2023年6月27日 |
|---|---|
| 演題名: | ヒト共生・未培養微生物におけるシングルセルゲノム解析の活用法 |
| 形式: | 口頭発表 |
第96回日本細菌学会総会
| 日程: | 2023年3月16日 |
|---|---|
| 演題名: | 微生物シングルセルゲノミクス：進歩と将来の展望 |
| 形式: | 口頭発表 |
IHMC2022(国際ヒトマイクロバイオームコンソーシアム2022)
| 日程: | 2022年11月10日 |
|---|---|
| 演題名: | Obtaining complete genomes from uncultured human gut bacteria with single-cell long-read sequencing |
| 形式: | 口頭発表 |
| 日程: | 2022年11月8-10日 |
|---|---|
| 演題名: | Exploring strain diversity in human microbiome using single-cell genome sequencing |
| 形式: | ポスター |
日本微生物生態学会第35回札幌大会
| 日程: | 2022年11月1日 |
|---|---|
| 演題名: | 日本微生物生態学会第35回札幌大会 |
| 形式: | 一般口頭発表 |
| 日程: | 2022年11月1‐ 2日 |
|---|---|
| 演題名: | 生菌選択的シングルセルゲノムシーケンスによる腸内微生物の株レベル解析 |
| 形式: | ポスター |
第36回 日本バイオフィルム学会学術集会
| 日程: | 2022年9月25日（日） |
|---|---|
| 演題名: | ファージ由来タンパク質”エンドライシン”の細菌感染症治療薬への応用 |
| 形式: | シンポジウム |
Enzyme Engineering XXVI
| 日程: | 2022年5月22日－27日 |
|---|---|
| 演題名: | Efficient enzyme discovery from complex environmental microbiota using microbial single-cell sequencing |
| 形式: | ポスター |
第95回日本薬理学会年会
| 日程: | 2022年3月8日 |
|---|---|
| 演題名: | 微生物シングルセルゲノム解析技術bit-MAP®を用いたエンドリシン創薬技術開発 |
| 形式: | 企業企画シンポジウム「マイクロバイオーム創薬」 |
第44回日本分子生物学会年会
| 日程: | 2021年12月1日 |
|---|---|
| 演題名: | ショットガンメタゲノム解析及びシングルセルゲノム解析による大腸がん患者の腸内細菌叢プロファイリング（SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN付随BIG BEN試験） |
| 形式: | ポスター |
第73回日本生物工学会大会
| 日程: | 2021年10月28日 |
|---|---|
| 演題名: | 未培養腸内細菌の１細胞ロングリードシーケンスによる完全長ゲノムの獲得 |
| 形式: | オンライン |
大阪大学蛋白質研究所主催セミナー
| 日程: | 2021年1月15日（金） 16:10 ~ 16:40 |
|---|---|
| 演題名: | シングルセルゲノミクスで未培養細菌ゲノムを網羅解析 |
| 形式: | オンライン |
第94回日本細菌学会総会 オンライン
| 日程: | 2021年3月24日 16:15－16:30 |
|---|---|
| 演題名: | ヒト皮膚常在細菌における種内多様性のシングルセル解析 |
| 形式: | オンライン |
生物工学Webシンポジウム2020 オンライン
| 日程: | 9月3日 15:30-17:30 |
|---|---|
| 演題名: | シングルセルゲノム解析が変革する海洋微生物研究 |
| 形式: | オンライン |
第43回日本分子生物学会年会 オンライン
| 日程: | 12月2日 14:15-15:15 |
|---|---|
| 演題名: | シングルセルゲノムを教師データとしたメタゲノムアセンブリの高品質化 |
| 形式: | ポスター |
| 日程: | 12月3日 13:15-14:15 |
|---|---|
| 演題名: | 微生物シングルセル解析プラットフォームbit-MAP®用いた土壌細菌の超並列ゲノム解析 |
| 形式: | ポスター |